A rejtélyekkel teli széria egy bentlakásos iskolában játszódik, amely a külvilágtól elszigetelten, egy kísérteties erdő mélyén bújik meg. Ide érkezik meg a szépséges, ámde vad természetű Maria (Marta Torné), aki egy pszichiátriai intézetből szökött meg. Takarítónőként áll munkába, de rögvest érezhető, hogy súlyos titka van, s valamit nagyon keres… Eközben a karizmatikus igazgató, Hector és számító élettársa, Elza közti kapcsolatot is sikerül feldúlnia.

Itt a szeptember, s az internátust hamarosan benépesítik a diákok, az alsósoktól egészen a tinédzserekig. Megismerjük Marcos (Martín Rivas) megindító történetét, aki szüleik eltűnése után kénytelen volt a nyáron hirtelen felnőtté válni, s gondját viselni kishúgának, Paulának (Carlota Garcia), aki a mai napig nem tudja, hogy szüleik már nem élnek.

Rögtön a tanév kezdetén eltűnik a közkedvelt történelemtanár, a kissé bogaras Alfonso, s kalandvágyó gimnazisták egy csoportja, Carolina, Victoria, Ivan, Cayetano és Roque veszélyes nyomozásba kezdenek. Az épületet lassan lappangó félelem járja át: pislákolnak a lámpák, magyarázat nélkül csapódnak ajtók, test nélküli árnyak suhannak az éjszakai folyosón, az erdőből pedig valaki szüntelen figyel…

Az Internátust a legnagyobb Spanyolországi díszletek között forgatják Madrid külvárosában. A díszlettervezők a baljós, misztikus hangulatot egy Roxfort-szerű iskola felépítésével kívánták elérni, és a sorozatot nézettségi adatait látva sikerült is nekik. A Marcost alakító Martín Rivas egyébként az Internátus kirobbanó sikerének köszönhetően ma Spanyolország elsőszámú tinisztárja, minden ifjúsági magazin címlapját bejárta már, és a csak neki szentelt internetes rajongói oldalak száma is jelzi, hogy a spanyol fiatalok körében ma nincs nagyobb kedvenc nála.